Natural da capital paulista, Basílio iniciou sua jornada no futebol profissional no Corinthians, clube que defendeu de 1977 a 1985. Ele estreou pelo Timão em 1978, ainda como volante. Ao todo, ele disputou 258 jogos pelo Alvinegro e foi campeão do Campeonato Paulista três vezes (1979, 1982 e 1983).
Com profunda tristeza, o São Paulo FC recebeu a notícia do falecimento de Wagner Basílio, aos 65 anos.
O ex-zagueiro fez parte do elenco campeão brasileiro de 1986 pelo Tricolor, sendo o autor da cobrança de pênalti que garantiu o título, e também conquistou o Paulista de 1987.… pic.twitter.com/kndtQiDlp6— São Paulo FC (@SaoPauloFC) July 16, 2025
Após a passagem pelo Corinthians, Basílio foi contratado pelo São Paulo, onde viveu um dos melhores momentos de sua carreira ao converter o pênalti decisivo da disputa contra o Guarani, em 1987, que rendeu ao Tricolor o título do Campeonato Brasileiro de 1986. Pelo time são-paulino, também foi campeão do Paulista de 1987 e disputou 96 jogos, com quatro gols marcados.
Ambos os times se manifestaram sobre o falecimento de Basílio. Além da dupla paulista, o ex-jogador também defendeu Sport e Bahia.